硫修饰核苷：硫代尿苷

硫代尿苷是一种尿嘧啶的氧原子被硫原子取代的修饰核苷，形成4-硫代尿苷和2-硫代尿苷。4-硫代尿苷是一种光激活的核苷，嵌入了4-硫代尿苷的RNA在UV光照射下可与相互作用蛋白交联，因此它可用于一种RNA分析和分离，即PAR-CLIP法¹⁾。另一方面，2-硫代尿苷是一种在tRNA中发现的硫修饰核苷。硫原子比氧原子具有更大的原子半径及更高的极化率，并能抑制错配碱基对的形成，因此含2-硫代尿苷的反义寡核苷酸和siRNA的选择性有望被提高²⁾。

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关键词

T4059

4-硫代尿苷

D6061

2'-脱氧-4-硫尿苷

D6030

2'-脱氧-2'-氟-4-硫代尿苷

T4108

2-硫代尿苷

文献

• 1) Transcriptome-wide identification of RNA-binding protein and microRNA target sites by PAR-CLIP
  • M. Hafner, M. Landthaler, L. Burger, M. Khorshid, J. Hausser, P. Berninger, A. Rothballer, M. Ascano Jr., A.-C. Jungkamp, M. Munschauer, A. Ulrich, G. S. Wardle, S. Dewell, M. Zavolan, T. Tuschl, Cell 2010, 141, 129.
• 2) Thermodynamics of RNA−RNA Duplexes with 2- or 4-Thiouridines:  Implications for Antisense Design and Targeting a Group I Intron
  • S. M. Testa, M. D. Disney, D. H. Turner, R. Kierzek, Biochemistry 1999, 38, 16655.

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