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核酸塩基特異的プローブ [RNA構造解析]
塩基特異的プローブとして、最初にRNA構造解析に用いられた小分子プローブであるDMSを始め、CMCTやケトキサールをなど多数の化合物が知られています。塩基特異的プローブを使用したすべてのヌクレオチドの構造情報の取得には、複数の試薬を使用する必要があります。
| プローブ | 優先修飾部位 | 製品コード |
|---|---|---|
| DMS | グアニン N7, アデニン N1, シトシン N3 | |
| DEPC | アデニン N7 | |
| CMCT | グアニン N1, ウラシル N3 | |
| Kethoxal | グアニン N1 および N4 | - |
| DMAS-Cl | グアニン N2 | - |
| Naz | グアニン C8, アデニン C8 |
略称
DMS: Dimethyl Sulfate; DEPC: Diethyl Pyrocarbonate, CMCT: 1-Cyclohexyl-3-(2-morpholinoethyl)carbodiimide Metho-p-toluenesulfonate; DMAS-Cl: N,N-(Dimethylamino)dimethylchlorosilane; Naz: Nicotinoyl Azide
DMS: Dimethyl Sulfate; DEPC: Diethyl Pyrocarbonate, CMCT: 1-Cyclohexyl-3-(2-morpholinoethyl)carbodiimide Metho-p-toluenesulfonate; DMAS-Cl: N,N-(Dimethylamino)dimethylchlorosilane; Naz: Nicotinoyl Azide
Naz（Nicotinoyl Azide）はLASER（Light Ativated Structural Examination of RNA）というRNA構造解析手法において、RNA中のプリン核酸塩基の溶媒アクセシビリティの調査に用いられています。
参考文献
- Probing the structure of RNAs in solution
- Chemical probes for higher-order structure in RNA
- DMS footprinting of structured RNAs and RNA–protein complexes
- Light-activated chemical probing of nucleobase solvent accessibility inside cells
- In Vitro Methods to Decipher the Structure of Viral RNA Genomes
![1-Cyclohexyl-3-(2-morpholinoethyl)carbodiimide Metho-p-toluenesulfonate [for Peptide Synthesis]](/medias/C0793.jpg?context=bWFzdGVyfHJvb3R8MzUxNTF8aW1hZ2UvanBlZ3xhREZsTDJobVpDODRPVEk1TXpReE5qQXpPRGN3TDBNd056a3pMbXB3Wnd8MDM1ZGFlYzMzM2Y0YzYzNWVlNmFkNDAxZGY1MTM0Y2Q4NGY0NjRmNjIxYWMwODAzYTVhOTFkZDJjMDVhYjZhMg "1-Cyclohexyl-3-(2-morpholinoethyl)carbodiimide Metho-p-toluenesulfonate [for Peptide Synthesis]")
| 製品コード | C0793 |
| CAS RN | 2491-17-0 |
| 純度（試験方法） | >96.0%(T)(N) |
製品コード: C0793 |
純度（試験方法）
>96.0%(T)(N)
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